182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_27980  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  100 
 
 		 300 aa  598  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.56 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09070  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  38.36 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00126145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  37.14 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  35.44 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.56 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  35.25 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  34.91 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2587  ABC-2 type transporter  34.97 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  34.49 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26460  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.55 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.02 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  21.32 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7634  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  22.47 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  23.3 
 
 		 604 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 633 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  22.56 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 606 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 570 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  24.44 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  20.99 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  24.06 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  24.59 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  22.78 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  21.25 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  26.42 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  27.97 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  25 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  24.34 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  23.16 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  21.98 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  23.05 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  21.07 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  22.26 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  21.61 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  22.18 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  22.57 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  26.32 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  19.2 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  21.98 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0940  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3932  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  18.92 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  23.17 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  23.17 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  21.61 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  19.91 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  20.54 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  21.05 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  21.05 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  23.17 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  21.4 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  18.6 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1227  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  21.48 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4146  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  hitchhiker  0.00000138 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  25.53 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  22.26 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  23.57 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  24.23 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  24.23 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  21.67 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  28.44 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  23.79 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  21.89 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>