178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26460 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26460  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  48.55 
 
 		 274 aa  258  9e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2587  ABC-2 type transporter  47.37 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  41.96 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  36.58 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  36.74 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.81 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  36.49 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  37.32 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09070  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.14 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00126145  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27980  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.55 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7634  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  22.47 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.41 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 633 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 606 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 604 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  24.23 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  20.38 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3946  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3015  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  24.34 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0998219  hitchhiker  0.0000148494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  21.09 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  21.94 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  28.93 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  21.64 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  23 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0297  tagG protein, teichoic acid ABC transporter protein, putative  25.36 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2634  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.79755  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  25.82 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3132  ABC-2 type transporter  21.4 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  21.01 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  21.45 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0661  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0928677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0676  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  21.66 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  19.31 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  20.3 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  22.33 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  25.73 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  23.55 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  23.23 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  23.23 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  23.49 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  22.27 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  21.03 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2573  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  19.85 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>