175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7634 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7634  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 327 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.31 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  29.51 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26770  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.81 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.99915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  27.65 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 274 aa  99  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  28.16 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  24.73 
 
 		 264 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09070  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.19 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00126145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.55 
 
 		 276 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26460  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.05 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27980  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.3 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  22.26 
 
 		 570 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 606 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 633 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  23.49 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  22.31 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  23.78 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  23.04 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  20.64 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  22.26 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  24.38 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2587  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  26.74 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  21.55 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  22.84 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  21.48 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  20.58 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  25.46 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  22.5 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  22.4 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  22.4 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  20.07 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  24 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  23.11 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  19.93 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  22.03 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  22.46 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  25.46 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  22.96 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  22.9 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  20.57 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  22.18 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  26.8 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  19.93 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  19.93 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  21.4 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  22.46 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  21.91 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  26.88 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  20.49 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  21.99 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5119  techoic acid ABC transporter efflux permease  25.51 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5511  techoic acid ABC transporter efflux permease  25.51 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5361  putative techoic acid ABC transporter, efflux permease  25.51 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  21.58 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  23.08 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  23.59 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2692  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  23.7 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  20.17 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  22.61 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  22.61 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0495  putative ABC-2 type transport system permease protein  21.11 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0237472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>