235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0847 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  100 
 
 		 283 aa  564  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  51.41 
 
 		 289 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  52.48 
 
 		 287 aa  295  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  51.76 
 
 		 287 aa  275  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  48.77 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  46.26 
 
 		 292 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 		 283 aa  244  9e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  45.42 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  39.93 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  46.03 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  41.28 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  37.82 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  38.61 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 		 273 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 		 273 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  33.81 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  34.35 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  39.41 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  32.62 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 		 279 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  33.45 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  33.84 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  33.45 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  32.06 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  32.18 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  32.18 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  36.84 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  31.56 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  35.68 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  27.27 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  30.55 
 
 		 633 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  29.32 
 
 		 264 aa  116  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 570 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  26.22 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  26.98 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 604 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 606 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  29.1 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  25.71 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 478 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 257 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  27.31 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2371  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145236 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  24.33 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  26.64 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 310 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  28.41 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  26.01 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1573  polysaccharide/polyol phosphate export systems permease  26.62 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.445511  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  26.24 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1435  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  26.04 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.52 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  24.72 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  24.62 
 
 		 257 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1686  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  25.11 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08880  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.37019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>