208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0370 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  37.7 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  36.11 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  31.62 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  34.66 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  34.25 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  33.78 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  33.79 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0495  putative ABC-2 type transport system permease protein  34.77 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0237472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 		 266 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  30.08 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3116  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4317  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  28.85 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1126  ABC transporter permease protein  26.79 
 
 		 277 aa  95.5  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 478 aa  95.5  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  27.17 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  27.31 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 289 aa  92  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2397  hypothetical protein  25.59 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0564424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 570 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0704  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  25.7 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  23.85 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  24.22 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  24.22 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  23.83 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0610  hypothetical protein  24.19 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  28.91 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  24.41 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  25.93 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0716  hypothetical protein  24.02 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3197  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0318  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4589  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0954  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  25.68 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  24.42 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  23.05 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  23.71 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  27.03 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0884  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 633 aa  75.5  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  29.2 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4002  hypothetical protein  25.59 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0519  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48708  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 604 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  21.01 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  21.85 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  26.51 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  20.78 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  24.46 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  24.8 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>