197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001784 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  100 
 
 		 260 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  34.39 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  34.39 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  33.6 
 
 		 258 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  32.89 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  28.98 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  30.59 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2467  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.750135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2736  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  26.69 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  26.69 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  26.69 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  26.69 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  26.69 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  26.69 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  29.96 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  26.48 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2382  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.63 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  29.63 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  27.82 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  27.45 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3848  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.800854 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.95 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  27.46 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03059  KpsM protein  25.78 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3240  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2608  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  25.52 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  26.47 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3573  putative ABC-2 type transporter  24 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.337642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3980  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, inner membrane subunit  27.68 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.693027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  23.55 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1076  O-antigen ABC transporter, permease protein, putative  26.92 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  23.76 
 
 		 264 aa  62  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3924  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  23.42 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  23.69 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  26.46 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2038  polysaccharide ABC transporter  25.18 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  25.53 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1386  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.823591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  24.51 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  21.33 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  21.36 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3799  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, innermembrane subunit  25.74 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1473  ABC-2 type transport system integral membrane protein  24 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.851952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  22.52 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  23.47 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1986  polysaccharide ABC transporter, permease protein, putative  24.11 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3160  ABC-2 type transport system integral membrane protein  24.11 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0927  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2757  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.011333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3100  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3137  putative lipopolysaccharide ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1848  putative polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  22.18 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0631  polysaccharide ABC transporter  26.76 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.238006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>