118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1506 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  45.74 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  45.74 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  45.74 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  45.74 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  45.74 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  45.74 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  43.77 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  42.37 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  41.76 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  41.73 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  43.41 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  44.49 
 
 		 260 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  44.24 
 
 		 219 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  41.45 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  38.89 
 
 		 281 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  38.89 
 
 		 377 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  39.17 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  34.92 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  29.88 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  30.86 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  30.74 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  30.74 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  28.63 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  24.39 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  26.42 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.52 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  28.63 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  26.38 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2467  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.750135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  27.85 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.13 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.13 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2382  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03059  KpsM protein  28.12 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3848  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.800854 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  22.81 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3240  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2736  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  21.63 
 
 		 478 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  23.45 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  25.17 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  29.81 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0631  polysaccharide ABC transporter  28.12 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.238006  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  26.39 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.87 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  30.77 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2608  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.77 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29480  putative permease of ABC-2 transporter  25.21 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2408  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 368 aa  45.8  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  34.33 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  34.33 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  28.36 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.07 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  24.22 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  32.84 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  29.06 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  34.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  34.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  34.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  34.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  32.84 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>