63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1151 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 263 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  71.37 
 
 		 264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  62.26 
 
 		 275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  59.54 
 
 		 271 aa  335  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  59.61 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  59.61 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  59.61 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  59.61 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  59.61 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  59.61 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  58.04 
 
 		 260 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  54.12 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  50.39 
 
 		 266 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  57.08 
 
 		 219 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  51.81 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  47.86 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  42.37 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  41.77 
 
 		 377 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  41.77 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  42.25 
 
 		 262 aa  208  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  35.89 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  28.86 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  25.1 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  25.21 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  28.1 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  28.11 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  24.36 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  24.39 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  25.68 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  24.47 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  23.44 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  24.89 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.2 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.2 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  27.11 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2736  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2467  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.750135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03059  KpsM protein  21.37 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2382  ABC-2 type transporter  21.89 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2608  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  22.41 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 		 478 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  23 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  23 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>