77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1621 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  89.23 
 
 		 260 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  63.57 
 
 		 258 aa  352  2.9999999999999997e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  36.25 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  34.5 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  34.5 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  34.24 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2608  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  27.84 
 
 		 302 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  29.76 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  27.64 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  27.24 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  28.29 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  28.64 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.15 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.15 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.15 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.15 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  29.15 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  29.15 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  25 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  26.42 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  28.82 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2736  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  25.66 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2038  polysaccharide ABC transporter  27.7 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  25.81 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2382  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2467  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.750135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03059  KpsM protein  24.32 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  24.02 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3240  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  22.41 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0631  polysaccharide ABC transporter  25 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.238006  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2301  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.153846  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  22.98 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3848  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.800854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  23.56 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.27 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  21.86 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3015  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  26.34 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0998219  hitchhiker  0.0000148494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  22.8 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3573  putative ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.337642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0860  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 324 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  22.47 
 
 		 282 aa  42  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  23.08 
 
 		 276 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>