54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0747 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  59.46 
 
 		 271 aa  348  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  57.92 
 
 		 260 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  57.92 
 
 		 260 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  57.92 
 
 		 260 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  57.92 
 
 		 260 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  57.92 
 
 		 260 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  57.92 
 
 		 260 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  54.12 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  52.9 
 
 		 264 aa  281  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  48.84 
 
 		 275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  54.79 
 
 		 219 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  48.09 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  47.06 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  46.27 
 
 		 260 aa  240  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  42.42 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  40.71 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  38.52 
 
 		 281 aa  188  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  38.52 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  35.38 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  33.98 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  31.78 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  23.95 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  23.41 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  23.41 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  23.81 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  25.45 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  27.35 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  25.22 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  26.04 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  25.75 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  26.53 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  23.51 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  21.61 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>