52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0746 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  63.05 
 
 		 253 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  52.78 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  52.78 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  52.78 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  52.78 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  52.78 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  52.78 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  50.39 
 
 		 263 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  46.77 
 
 		 271 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  49.22 
 
 		 275 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  49.8 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  42.42 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  44.88 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  49.31 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  45.21 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  45.21 
 
 		 377 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  44.96 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  36.19 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  37.15 
 
 		 265 aa  168  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  35.91 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  26.54 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  25.67 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  25.67 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  24 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  24 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  29.93 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  22.82 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  22.8 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2736  ABC-2 type transporter  23.93 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  21.86 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  24.32 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  21.03 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  21.03 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  21.49 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  20.89 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  21.88 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>