121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2581 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  33.87 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  29.55 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  29.55 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  28.34 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2467  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.750135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  28.96 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  27.13 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2382  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 264 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  29.12 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  26.05 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  27.56 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3848  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.800854 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  28.08 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 377 aa  82.4  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  27.46 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  26.29 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.91 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  27.91 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.91 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.91 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.91 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  27.91 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  23.81 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2736  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  27.13 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.85 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  26.85 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  25.6 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  24.8 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  23.62 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  23.87 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03059  KpsM protein  26.57 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3817  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0117338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3573  putative ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.337642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2410  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3240  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2301  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.153846  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 606 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  25.11 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  22.73 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2608  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 202 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  25.85 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 604 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  23.74 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  22.07 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  22.55 
 
 		 570 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  23.79 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  23.79 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8935  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component-like protein  24.57 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  25.63 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  27.72 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4966  teichoic acid translocation permease; teichoic acid ABC transporter, permease  22.61 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3312  ABC transporter protein  24.88 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 478 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1846  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.461285  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  25.6 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1284  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  19.74 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1220  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0370  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.74 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 294 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 277 aa  45.4  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  21.53 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>