15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2301 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2301  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 273 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.153846  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3573  putative ABC-2 type transporter  47.99 
 
 		 273 aa  275  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.337642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0012  ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.591575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0214  ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 		 273 aa  258  8e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.848634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  23.12 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  23.12 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3240  ABC-2 type transporter  23.78 
 
 		 198 aa  52.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  27.09 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  26.39 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  26.67 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  26.67 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>