14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0214 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0214  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.848634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0012  ABC transporter, permease protein  50.55 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.591575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3573  putative ABC-2 type transporter  46.15 
 
 		 273 aa  265  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.337642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2301  ABC-2 type transporter  43.96 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.153846  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  20.95 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1950  polysialic acid transport protein  23.53 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  21.77 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2608  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  20.24 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  20.24 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  21.88 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>