61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0661 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  43.13 
 
 		 265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  42.25 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  39.76 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  36.19 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  38.05 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  36.29 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  36.29 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  36.29 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  36.29 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  36.29 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  36.29 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  36.33 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  37.78 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  32.68 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  32.68 
 
 		 377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  32.41 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  31.92 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  27.2 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  27.42 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.2 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.2 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  22.98 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  25.91 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  36.7 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  25.87 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  25.87 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  22.73 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2757  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  23.18 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2689  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.908796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3848  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.800854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2382  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  23.87 
 
 		 272 aa  48.5  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  22.84 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03059  KpsM protein  22.69 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2467  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.750135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  21.11 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>