More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3318 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 305 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  65.44 
 
 		 315 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  60.2 
 
 		 302 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  59.59 
 
 		 298 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  60.2 
 
 		 302 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  61.07 
 
 		 302 aa  359  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 299 aa  352  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  62.05 
 
 		 306 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  57.88 
 
 		 300 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 300 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  57.19 
 
 		 310 aa  341  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  57.88 
 
 		 299 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  57.88 
 
 		 300 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 310 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  57.88 
 
 		 300 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  58.36 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  56.66 
 
 		 307 aa  338  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  56.48 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  58.11 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 299 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 322 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 289 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  53.82 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  47.08 
 
 		 314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 304 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 307 aa  258  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  45.73 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 305 aa  248  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.25 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  43.25 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  43.25 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 311 aa  245  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  43.54 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 295 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 329 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  42.96 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  40.97 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5891  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0761198  normal  0.505648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  43.25 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.12 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  42.67 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  43.64 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  40.91 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>