More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2777 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  567  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  75.35 
 
 		 303 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  78.17 
 
 		 302 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  73.26 
 
 		 303 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  77.89 
 
 		 306 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  76.76 
 
 		 302 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  76.06 
 
 		 302 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  74.74 
 
 		 300 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  73.01 
 
 		 310 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  74.74 
 
 		 300 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  74.22 
 
 		 299 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  71.88 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  72.66 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  71.78 
 
 		 299 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  71.93 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 301 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 299 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  70.88 
 
 		 300 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  70.53 
 
 		 306 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  70.53 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  69.1 
 
 		 322 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  57.59 
 
 		 302 aa  316  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  60 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 310 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 305 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  52.96 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  52.65 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 304 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  46.69 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 300 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 303 aa  224  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  51.04 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  47.04 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  46.32 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  44.1 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.4 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  42.4 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  44.76 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  42.4 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  42.05 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  41.7 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  43.36 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  42.66 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  41.26 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  42.05 
 
 		 324 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  40.83 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  41.88 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  41.52 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  45.64 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  40.91 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  40.56 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  40.56 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  42.2 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  43.55 
 
 		 300 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  40.77 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  44.76 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  42.96 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>