More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7194 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  86.32 
 
 		 324 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 314 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  57.1 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 322 aa  326  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  56.01 
 
 		 296 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 296 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 300 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 324 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 300 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 301 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 300 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  52.25 
 
 		 301 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 305 aa  302  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  53.87 
 
 		 310 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  53.87 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  53.87 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 297 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  48.64 
 
 		 294 aa  281  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  50.18 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 300 aa  271  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 297 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  46.78 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  50.85 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  47 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.96 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 299 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  47.42 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  43.58 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.73 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  40.73 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  40.73 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  47.08 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  41.67 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.52 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  42.07 
 
 		 303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  43.62 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  42.91 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 300 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  45.89 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  43.77 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  44.93 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 304 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  43.54 
 
 		 300 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 299 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  42.52 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  44.37 
 
 		 299 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  42.52 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  43.92 
 
 		 303 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>