More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3090 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  71.95 
 
 		 304 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  61.72 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  61.72 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  46.6 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  46.96 
 
 		 300 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  46.1 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  46.42 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  42.41 
 
 		 294 aa  251  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 301 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 300 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 300 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.8 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  39.8 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  40.68 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.48 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 301 aa  218  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  38.44 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  40.54 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 305 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0716  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  40.69 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  37.07 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  40.48 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 302 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  38.7 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6827  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 308 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>