More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0716 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0716  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 294 aa  598  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2118  LysR family transcriptional regulator  79.59 
 
 		 294 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0326  LysR substrate binding domain protein  78.57 
 
 		 294 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.457404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 297 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 		 297 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 297 aa  261  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  45.55 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  44.37 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  44.83 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  44.86 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  44.86 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  44.18 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 306 aa  252  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 297 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  44.86 
 
 		 297 aa  251  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  46.76 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  44.18 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  44.18 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  45.55 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  45.05 
 
 		 296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 300 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  46.08 
 
 		 297 aa  241  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6827  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  43.15 
 
 		 300 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  44.86 
 
 		 310 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 295 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  43.94 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 291 aa  234  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4793  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 328 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  42.12 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.21 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  44.18 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  44.18 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5478  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4886  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5384  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6790  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5627  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 297 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35490  LysR family transcriptional regulator protein  42.12 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6375  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 297 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.429031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  44.52 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 297 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0654  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1976  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1541  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2296  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01306  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.93 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.387264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2317  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.342284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1444  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01316  hypothetical protein  39.93 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1568  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2045  transcriptional regulator, LysR family  45.55 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1793  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4225  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.795038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  41.11 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>