More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5385 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
301 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
301 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  99.34 
 
 
301 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  70.57 
 
 
301 aa  441  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  54.79 
 
 
297 aa  338  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  56.79 
 
 
297 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  52.9 
 
 
300 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 
299 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  53.58 
 
 
302 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 
312 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
297 aa  331  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  53.58 
 
 
298 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  52.38 
 
 
297 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  54.45 
 
 
295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  54.95 
 
 
297 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 
297 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 
297 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  53.38 
 
 
306 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  52.4 
 
 
297 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  53.24 
 
 
297 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  53.77 
 
 
297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  52.38 
 
 
297 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
297 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  51.7 
 
 
299 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  50.85 
 
 
300 aa  315  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 
297 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  51.36 
 
 
297 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  56.1 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  52.05 
 
 
300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35490  LysR family transcriptional regulator protein  50.51 
 
 
297 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50.87 
 
 
297 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  53.92 
 
 
310 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
297 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 
297 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  51.19 
 
 
297 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  51.19 
 
 
297 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  50.85 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5478  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5384  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4886  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  51.19 
 
 
297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  54.27 
 
 
297 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  48.46 
 
 
297 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  48.46 
 
 
297 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
297 aa  298  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6827  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
297 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  48.46 
 
 
297 aa  298  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 
295 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 
298 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  51.02 
 
 
306 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  48.46 
 
 
304 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
297 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0654  transcriptional regulator, LysR family  51.54 
 
 
297 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
299 aa  292  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
297 aa  292  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  48.46 
 
 
297 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2045  transcriptional regulator, LysR family  54.27 
 
 
297 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159657  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4793  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6790  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
301 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6375  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 
297 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.429031 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5627  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 
297 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 
303 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  51.19 
 
 
297 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
295 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
295 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  48.46 
 
 
296 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01306  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.71 
 
 
299 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.387264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2317  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 
299 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.342284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1444  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
299 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01316  hypothetical protein  44.71 
 
 
299 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2296  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 
299 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1793  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
299 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1976  transcriptional regulator, LysR family  44.37 
 
 
299 aa  265  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.748438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1541  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
299 aa  265  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 
297 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
297 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 
297 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0934  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 
299 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.411668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1568  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 
299 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 
297 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4225  LysR family transcriptional regulator  49.43 
 
 
275 aa  258  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.795038  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
305 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 
297 aa  252  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0476  LysR family transcriptional regulator  48.34 
 
 
318 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
298 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
301 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 
294 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  41.55 
 
 
314 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
314 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
304 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  41.3 
 
 
296 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
300 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 
301 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>