More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6722 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 310 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 310 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  72.61 
 
 		 324 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  57.3 
 
 		 324 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  53.63 
 
 		 297 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  54.12 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  53.87 
 
 		 312 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 302 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 300 aa  276  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 298 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  46.5 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  44.76 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  45.02 
 
 		 303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  44.83 
 
 		 300 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 303 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  45.86 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 301 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 295 aa  255  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  45.86 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  46.08 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  46.29 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  43.99 
 
 		 303 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  43.21 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.36 
 
 		 302 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 302 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 302 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  42.36 
 
 		 302 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 302 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 299 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  46.13 
 
 		 300 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  46.13 
 
 		 300 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  43.6 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  44.83 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 307 aa  244  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  42.61 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  43.4 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  43.4 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 297 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.82 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  46.9 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  43.71 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  42.56 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  43.46 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  43.45 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  45.88 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  41.52 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  45.61 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  44.06 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  45.3 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>