More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5667 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 300 aa  613  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  55.37 
 
 		 300 aa  332  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  50.34 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  50 
 
 		 303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 312 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  46.98 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  47.81 
 
 		 304 aa  278  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  47.81 
 
 		 304 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  46.08 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 300 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.08 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  36.08 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 312 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  40.55 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.5 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 300 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 300 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  38.44 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 314 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  39.93 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 300 aa  201  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 300 aa  201  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  37.54 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  40.88 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  36.64 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  40.62 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>