More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1524 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.72 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  41.72 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  41.72 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  43.3 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 300 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5844  transcriptional regulator, LysR family  43.99 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10316  normal  0.238321 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  41.32 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 297 aa  235  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1168  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  41.1 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  41.99 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 295 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1568  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 299 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  41.11 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1541  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 329 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2296  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01306  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.83 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.387264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2317  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.342284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1444  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01316  hypothetical protein  38.83 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1976  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 324 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  40.55 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1793  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  44.86 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  44.25 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4844  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  42.05 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  40.07 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  42.11 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  42.21 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  39.15 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  38.01 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4886  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5384  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>