More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1735 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  84.75 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 297 aa  309  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  54.52 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 300 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  48.3 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  51.86 
 
 		 294 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 301 aa  279  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 300 aa  278  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  47.65 
 
 		 297 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  50.85 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.32 
 
 		 298 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 297 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  49.12 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 300 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 295 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 296 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  47.26 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  47.26 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  46.44 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  48.83 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 291 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  48.83 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 306 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  47.65 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  46.23 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  46.44 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  46.62 
 
 		 305 aa  254  9e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  47.8 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  49.83 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  49.5 
 
 		 299 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  44.75 
 
 		 300 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  44.75 
 
 		 300 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  48.47 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  51.01 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  45.08 
 
 		 297 aa  248  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  44.97 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  45.64 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  47.14 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  46.1 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  47.46 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 312 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  46.1 
 
 		 301 aa  245  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 300 aa  245  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 289 aa  244  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  47.3 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  46.13 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>