More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6341 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 303 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  89.74 
 
 		 303 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  81.13 
 
 		 306 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  81.76 
 
 		 302 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  80.74 
 
 		 302 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  81.08 
 
 		 302 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  77.08 
 
 		 300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  78.45 
 
 		 300 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  78.45 
 
 		 300 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  78.33 
 
 		 299 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  77.44 
 
 		 299 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  77.52 
 
 		 299 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  76.41 
 
 		 310 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  76.08 
 
 		 300 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  73.83 
 
 		 298 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  74.25 
 
 		 306 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  75.35 
 
 		 289 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  69.7 
 
 		 310 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  69.26 
 
 		 301 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  70.85 
 
 		 300 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  67.22 
 
 		 322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  59.53 
 
 		 305 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  59.14 
 
 		 315 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 302 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  52.53 
 
 		 300 aa  302  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 301 aa  235  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 303 aa  235  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  44.3 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  45.67 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  44.7 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 300 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  42.42 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.26 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  39.26 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  44.59 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 324 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  47.32 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  41.21 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  43.71 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  41.28 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 300 aa  205  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  41.46 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  43.3 
 
 		 324 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  41.47 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>