More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2943 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  603  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  58.31 
 
 		 300 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 301 aa  358  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 298 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  54.21 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 299 aa  288  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  51.93 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  48.98 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  46.94 
 
 		 314 aa  281  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  46.42 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 297 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  49.65 
 
 		 301 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  48.11 
 
 		 297 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 297 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  49.31 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 305 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  49.16 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 302 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  47.65 
 
 		 304 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 291 aa  271  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 305 aa  271  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  48.61 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  47.12 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  45.79 
 
 		 297 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 303 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 301 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  42.47 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.95 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  46.1 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  46.1 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  47.47 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  49.15 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  48.97 
 
 		 302 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 303 aa  265  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  48.43 
 
 		 312 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 		 302 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  46.78 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 300 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  48.62 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  51.02 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  46.13 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  46.67 
 
 		 303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 		 297 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2045  transcriptional regulator, LysR family  52.19 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 297 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 304 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 322 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  48.1 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  46.98 
 
 		 295 aa  251  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  42.31 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  45.8 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  45.12 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  43.62 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 299 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>