More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5722 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  52.9 
 
 		 312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 324 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 298 aa  278  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  44.83 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  44.83 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 322 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 324 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  45.08 
 
 		 311 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 305 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  43.1 
 
 		 300 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 302 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  42.32 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.04 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  42.12 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  39.04 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  42.52 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  41.3 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.83 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 304 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.71 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  42.62 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  40.74 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  43.05 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  43.05 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  43.05 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  42.38 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  41.39 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35490  LysR family transcriptional regulator protein  40.41 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  42.14 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>