More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3825 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  78.6 
 
 		 322 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  75.6 
 
 		 296 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  74.23 
 
 		 296 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  65.77 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 298 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  60.88 
 
 		 300 aa  359  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  60.88 
 
 		 300 aa  359  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  57.1 
 
 		 312 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 300 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.67 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  41.67 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 300 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  51.01 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  43.48 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  40.14 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 301 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 297 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.1 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  39.33 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 297 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  39.66 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  39.07 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  40.99 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  38.68 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  38.64 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  37.28 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  36.95 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2045  transcriptional regulator, LysR family  43.01 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>