More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  74.75 
 
 		 303 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  74.75 
 
 		 303 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  57 
 
 		 312 aa  346  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  55.37 
 
 		 300 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  50.67 
 
 		 304 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  50.67 
 
 		 304 aa  285  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  45.95 
 
 		 304 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 305 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 310 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.04 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  39.04 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 307 aa  232  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  44.18 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 298 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.31 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 314 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  41.52 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 		 304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 300 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 322 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  43.79 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  38.7 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 299 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  40.07 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 291 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  39.73 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 296 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  41.34 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  42.32 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>