More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3219 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  67.33 
 
 		 301 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 304 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3171  LysR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3362  transcriptional regulator, LysR family  61.87 
 
 		 305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3288  transcriptional regulator, LysR family  63.55 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  42.51 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  40.42 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  42.37 
 
 		 294 aa  224  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 297 aa  225  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.76 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  41.11 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  39.93 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 305 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  39.93 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  41.52 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  44.93 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  41.18 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 327 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  43.15 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 329 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 301 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 301 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2586  carbonate dehydratase  39.51 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  41.52 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 307 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  38.68 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.68 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0775  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.02 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  38.11 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  37.02 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 322 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4844  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  40.27 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 308 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2066  transcriptional regulator, LysR family  38.11 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  40 
 
 		 297 aa  201  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>