More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7340 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7268  LysR family transcriptional regulator  69.64 
 
 		 321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  65.4 
 
 		 324 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 308 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  55.12 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 		 304 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  42.47 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  42.75 
 
 		 297 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 302 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 298 aa  222  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 295 aa  221  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  39.93 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 305 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 301 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  39.56 
 
 		 297 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  40.94 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0476  LysR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  39.64 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  37.98 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.96 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  40.71 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  35.96 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  37.81 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  40.85 
 
 		 298 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  41.05 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40.62 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  40.62 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 298 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2045  transcriptional regulator, LysR family  42.11 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>