More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0900 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  622  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5891  LysR family transcriptional regulator  60.34 
 
 		 295 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0761198  normal  0.505648 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0322  transcriptional regulator, LysR family  60.47 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.785134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  56.12 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  54.42 
 
 		 298 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 297 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 302 aa  228  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.44 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  38.44 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  40.07 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  40.75 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  38.13 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 299 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 302 aa  201  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 302 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  39 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  39 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0654  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  34.01 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  37.41 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.73 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  38.21 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>