More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0322 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0322  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.785134 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5891  LysR family transcriptional regulator  74.92 
 
 		 295 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0761198  normal  0.505648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 300 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  55.29 
 
 		 298 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  55.63 
 
 		 298 aa  331  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 297 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00241  predicted transcriptional regulator  97.35 
 
 		 136 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00244  hypothetical protein  97.35 
 
 		 136 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3322  hypothetical protein  97.35 
 
 		 136 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3337  hypothetical protein  97.35 
 
 		 136 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.853858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  40.47 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 300 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 327 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  39.22 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 302 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  39.22 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0654  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  38.65 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 324 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  37.2 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  37.2 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  40.28 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  37.59 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  35.93 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.13 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  34.13 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0025  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>