More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1924 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 303 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  44.29 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  41.72 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  41.72 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  44.3 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5891  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0761198  normal  0.505648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  42.18 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  41.1 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 302 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 302 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 308 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  40.99 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 307 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  42.96 
 
 		 297 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 300 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 329 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0322  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.785134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  45.55 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  44.1 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.14 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  36.14 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  36.14 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.38 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  42.01 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  40.28 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  39.79 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 296 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0476  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2045  transcriptional regulator, LysR family  43.4 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  37.72 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>