More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3178 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  63.04 
 
 		 302 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  63.04 
 
 		 302 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 302 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 302 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 302 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  63.04 
 
 		 302 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  46.9 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  45.33 
 
 		 295 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  43.19 
 
 		 302 aa  252  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  42.86 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  43.06 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  42.19 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  41.72 
 
 		 300 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 300 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  42.23 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  41.25 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 300 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 311 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 301 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  45.05 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  40.07 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  40.59 
 
 		 303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  39.86 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  42.05 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.22 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  40.61 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.21 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  44.98 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  39.93 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 299 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 297 aa  225  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  42.91 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  40.86 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 297 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 		 297 aa  222  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>