More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0217 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  597  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  99.01 
 
 		 302 aa  587  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  90.37 
 
 		 302 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  83.11 
 
 		 303 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  82.15 
 
 		 306 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  81.08 
 
 		 303 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  78.98 
 
 		 299 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  79.66 
 
 		 300 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  79.66 
 
 		 300 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  77.29 
 
 		 300 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  73.99 
 
 		 298 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  76.27 
 
 		 300 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  76.27 
 
 		 310 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  75.43 
 
 		 310 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  73.04 
 
 		 301 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  75.43 
 
 		 300 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  73.9 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  75.34 
 
 		 299 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  74.66 
 
 		 299 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  76.06 
 
 		 289 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  70.99 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 303 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  60.75 
 
 		 299 aa  340  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 302 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  61.02 
 
 		 315 aa  326  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  55.67 
 
 		 300 aa  318  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 304 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 298 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 297 aa  262  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.36 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  41.36 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  41.36 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  47.08 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  46.62 
 
 		 294 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  43.84 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  47.3 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 305 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  46.05 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  46.39 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  45.61 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  43.06 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 314 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  43.16 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 311 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  42.52 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  43.15 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  42.76 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  42.81 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 295 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  42.32 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  44.48 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>