More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6771 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 301 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  70.31 
 
 		 297 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  63.14 
 
 		 305 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  52.25 
 
 		 312 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 300 aa  291  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 301 aa  288  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 300 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  47.59 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 297 aa  278  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  45.7 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 299 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  45.26 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  44.64 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  44.79 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 301 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  43.64 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  46.92 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  45.83 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.75 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  41.75 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 305 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 301 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  43.06 
 
 		 295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  44.14 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  44.09 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  44.48 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  43.64 
 
 		 297 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  43.21 
 
 		 297 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.86 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  46.05 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  46.96 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 296 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  41.84 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  45.52 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  45.02 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  42.51 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  41.87 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  44.3 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  43.01 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  43.48 
 
 		 296 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  46.39 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>