More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3051 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  74.32 
 
 		 302 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  75 
 
 		 302 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  73.06 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  74.75 
 
 		 300 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  75.59 
 
 		 306 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  74.75 
 
 		 300 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  73.99 
 
 		 302 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  74.16 
 
 		 303 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  73.06 
 
 		 300 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  73.83 
 
 		 303 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  72.73 
 
 		 299 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  71.04 
 
 		 306 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  69.39 
 
 		 310 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  69.05 
 
 		 301 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 300 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  70.71 
 
 		 299 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  70.13 
 
 		 299 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  71.93 
 
 		 289 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  66.78 
 
 		 322 aa  417  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 303 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  59.93 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 302 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  57 
 
 		 305 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  53.61 
 
 		 300 aa  311  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  47.96 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  44.63 
 
 		 294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  42.61 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 291 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.73 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  39.73 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 302 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  45.39 
 
 		 297 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  45.39 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  44.21 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  43.6 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  40.47 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 311 aa  215  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  42.41 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  42.23 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  38.85 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>