More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1179 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 301 aa  291  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  48.3 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 300 aa  285  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  54.73 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  52.41 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 		 297 aa  272  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  48.15 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  47.08 
 
 		 314 aa  268  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  46.78 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  48.07 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  47.24 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  47.42 
 
 		 299 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 297 aa  265  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  48.01 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  48.63 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  47.57 
 
 		 305 aa  262  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 311 aa  261  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 310 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  50 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 310 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 310 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 324 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  48.33 
 
 		 306 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 304 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  46.44 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 309 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  48.82 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  45.58 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  45.12 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  47.2 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 302 aa  251  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.9 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  44.9 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 324 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 297 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 302 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.88 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  46.94 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  46.94 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  44.21 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  43.29 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  49.16 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  45.91 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  47.6 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.1 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  47.81 
 
 		 297 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  48.62 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  42.76 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  42.76 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  46.44 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 299 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  44.03 
 
 		 300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>