More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3562 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  98.32 
 
 		 299 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  81.14 
 
 		 310 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  80.81 
 
 		 300 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  78.11 
 
 		 300 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  78.67 
 
 		 303 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  78.33 
 
 		 303 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  78.52 
 
 		 300 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  78.52 
 
 		 300 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  76.09 
 
 		 299 aa  457  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  77.7 
 
 		 302 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  76.35 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  73.24 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  75.34 
 
 		 302 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  70.13 
 
 		 298 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 301 aa  417  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  72.39 
 
 		 306 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 300 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  67.23 
 
 		 310 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 302 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 303 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  59.93 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  55.29 
 
 		 300 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 307 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  48.66 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  45.97 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  46.62 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  46.67 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.94 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  40.94 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  44.63 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 303 aa  231  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  48.82 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  44.11 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 291 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  45.67 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  44.97 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 297 aa  222  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 297 aa  222  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  42.03 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  45.17 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  42.42 
 
 		 300 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  43.92 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 295 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 311 aa  214  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  43.96 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>