More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1684 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 314 aa  638    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 297 aa  281  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  50.18 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 303 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 303 aa  268  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  46.02 
 
 		 295 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  48.3 
 
 		 298 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  47.96 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 302 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  49.32 
 
 		 302 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.28 
 
 		 298 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  45.67 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  47.77 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 301 aa  262  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  48.25 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  48.25 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  48.6 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 310 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  44.64 
 
 		 301 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  47.42 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 300 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 302 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.39 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  43.39 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 298 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  43.92 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  46.18 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.18 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  43.69 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  45.76 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 304 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 305 aa  239  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  44.6 
 
 		 307 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 322 aa  235  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4225  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 275 aa  235  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.795038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 297 aa  235  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  43.6 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 324 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>