More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2684 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 306 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  75.33 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  74.83 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  75.17 
 
 		 310 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  75.33 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  75.17 
 
 		 300 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  72.61 
 
 		 303 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  74.25 
 
 		 303 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  71.04 
 
 		 298 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  72.24 
 
 		 299 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  73.9 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  73.9 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  73.24 
 
 		 299 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  73.4 
 
 		 299 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  74.58 
 
 		 302 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  73.6 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 289 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 300 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  66.1 
 
 		 310 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  64.21 
 
 		 301 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  64.97 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 		 299 aa  331  9e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 305 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 302 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  57.58 
 
 		 315 aa  310  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  54.11 
 
 		 300 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 307 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 304 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  52.01 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  47.42 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 301 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.25 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  41.25 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  41.25 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  45.89 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 		 294 aa  231  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  46.39 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  42.23 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  43.4 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  45.64 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  45.58 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 314 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  45.05 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  44.26 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  44.93 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 291 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  44.14 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  42.41 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  43.69 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  42.57 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  41.02 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>