More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1369 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 295 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  94.58 
 
 		 295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  48.66 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  45.67 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  46.78 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 300 aa  251  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  46.28 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  43.69 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.61 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 301 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  45.73 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 291 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 298 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.54 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  46.08 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  41.38 
 
 		 300 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  40.75 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  42.61 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  46.37 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 298 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 310 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 329 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  43.15 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 300 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.48 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  45.02 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  40.48 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 302 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 297 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 312 aa  225  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>