More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1277 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  57.97 
 
 		 303 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  56.95 
 
 		 303 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  57 
 
 		 300 aa  346  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  47.33 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  47.99 
 
 		 304 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  44.55 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  44.97 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  44.97 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 297 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 295 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  42.32 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  38.1 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  38.44 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 291 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  39.73 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 306 aa  205  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 300 aa  205  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 297 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 297 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  39.25 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.1 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6827  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3362  transcriptional regulator, LysR family  39.13 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>