More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3362 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3362  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  88.37 
 
 		 304 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3171  LysR family transcriptional regulator  90.82 
 
 		 305 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3288  transcriptional regulator, LysR family  89.84 
 
 		 305 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 301 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  59.25 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  43.6 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.5 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  45.64 
 
 		 303 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  45.97 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  45.17 
 
 		 300 aa  225  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 303 aa  221  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  42.56 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  41.36 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  44.29 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 305 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  43.24 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  44.93 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  40.34 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 299 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5844  transcriptional regulator, LysR family  43.45 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10316  normal  0.238321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  44.1 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  41.36 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 300 aa  205  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  41.36 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 305 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  39.31 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  39.31 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5891  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0761198  normal  0.505648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0775  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  37.72 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5627  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>