More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5844 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5844  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10316  normal  0.238321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  71.57 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  54.82 
 
 		 308 aa  326  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4844  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0775  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 314 aa  211  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2066  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  39.3 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  39.32 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 329 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  39.08 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  46.48 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  40.49 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  38.23 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.75 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  36.75 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3362  transcriptional regulator, LysR family  43.45 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2586  carbonate dehydratase  37.72 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3171  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 305 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  41.13 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  39.22 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1568  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  37.94 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  35.76 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35490  LysR family transcriptional regulator protein  35.44 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1976  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1541  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>