More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3171 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3171  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3288  transcriptional regulator, LysR family  96.39 
 
 		 305 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3362  transcriptional regulator, LysR family  90.82 
 
 		 305 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  87.09 
 
 		 304 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 301 aa  362  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  60.48 
 
 		 301 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.48 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  45.3 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  45.64 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  44.98 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  43.15 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 308 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  42.71 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  43.58 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  41.91 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 307 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 307 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  40.74 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  41.02 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 324 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0775  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 300 aa  208  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  42.81 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5844  transcriptional regulator, LysR family  41.26 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10316  normal  0.238321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 294 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  39.31 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  39.31 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  42.32 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2066  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  42.32 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  40.14 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>