More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3142 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5844  transcriptional regulator, LysR family  54.82 
 
 		 302 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10316  normal  0.238321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  43.4 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 300 aa  222  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 302 aa  221  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4844  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.75 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  43.01 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.22 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  39.22 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  39.22 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  42.29 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  39.44 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  39.07 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  40.21 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 291 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3171  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  40.42 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 297 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  38.06 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3362  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  36.11 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  37.19 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  37.46 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  37.24 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 300 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2066  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  39.12 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7268  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1168  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.391598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>