More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7268 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7268  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  69.64 
 
 		 327 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  59.12 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 308 aa  352  7e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  52 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  45.76 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  40.89 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 301 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 297 aa  215  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  42.57 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 299 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  39.56 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  39.93 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 297 aa  209  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  38.95 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  40.5 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.44 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 295 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  38.71 
 
 		 296 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  41.1 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.19 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.17 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  35.17 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  35.17 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4793  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 297 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  39.49 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  38.08 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  38.03 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0934  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  38.71 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>